Entre as principais maneiras de se comprovar a qualidade de educação oferecida por uma cidade, está o Ideb – Índice de Desenvolvimento da Educação Básica. Atualmente a nota de Várzea Paulista é 6,5, superando a média nacional – de 5,8; a média estadual – 6; a média das redes municipais – 5,6 e a média da rede pública – 5,5.
Além da pontuação, as notas da educação de Várzea Paulista vêm aumentado constantemente, tendo um crescimento de 23% entre 2011 e 2018. Algumas escolas superam até mesmo a média municipal, como é o caso da Cemeb João Aprillanti, na Vila Santa Terezinha, com nota do Ideb de 7,4 e a Cemeb Oswaldo Camargo Pires, na Vila Tupi, com nota de 7,2.
